L'Istituto San Giorgio per i figli della gente di mare nasce giusta con Presidente della Repubblica nel 1972. Esso è erede della Casa Orfani Gente di Mare dovuta alla fusione, nel 1939, della Casa Orfani Marina Mercantile, fondata con Regio decreto nel 1930, e dell'Asilo per gli Orfani della Gente di Mare nato nel 1894.
Nel maggio del 2002, il Consiglio di Amministrazione ha trasformato l'Istituto in Fondazione ONLUS di cui si pubblica lo Statuto redatto nel 2009.